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数学所主办了《数学学报》（中、英文版）、《数学译林》和《代数集刊》（英文版）等杂志。
《数学学报》中文版是全国核心数学期刊，英文版现由德国斯普林格出版社出版，是SCI收录杂志之一。http://www.actamath.com
《数学译林》主要翻译介绍国际上重要的数学进展、学科和专题以及人物传记和有趣的数学史料等，是一份科普性较强的读物，拥有很广泛的读者群体。http://yilin.math.ac.cn/
《代数集刊》刊登代数学及相关领域高水平的创造性论文，确保学术质量，把办成有国际影响的高水平学术刊物作为奋斗目标。http://algebra.math.ac.cn/
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